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- 1、小豌豆中有大秘密 中国豌豆基因组高质量精细物理图谱绘制成功
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1、小豌豆中有大秘密 中国豌豆基因组高质量精细物理图谱绘制成功
1865年,遗传学之父孟德尔,在两万多株豌豆杂交实验中,第一次发现了基因的遗传规律,奠定生物遗传学的基础。一百多年后,中国科学家第一次成功绘制出了中国豌豆基因组高质量精细物理图谱。
该成果于9月22日23点在《自然-遗传学》杂志以长文形式在线发表。研究由中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用创新团队联合国内外多家合作单位完成。
豌豆是人类驯化最早的植物之一,但它的复杂性,使得人们揭开它基因秘密的时间却更晚。中国农科院供图
豆子里的秘密 深藏了一百多年
豌豆原产于西亚和地中海等地区,是人类作物中的“老字号”,有超过万年的驯化史,是粮、菜、饲、绿肥兼用的作物。当前,全球干豌豆种植面积近一亿亩,青豌豆种植面积超过三千万亩。在我国,干豌豆种植面积接近一千五百万亩,青豌豆种植面积超过两千万亩。
豌豆还是现代生物遗传学中的“明星”,150多年前,生物遗传学之父孟德尔,最早在豌豆中发现了基因遗传的秘密,并总结出遗传学第一定律和第二定律,成为现代生物遗传学的基础。
随着科学技术的进步,越来越多的物种,完成了全基因组的测序,但最早把基因的秘密展示给世人的豌豆,却一直缺乏高质量的基因组物理图谱。
中国农业科学院作物科学研究所研究员宗绪晓介绍,“自孟德尔发现遗传定律以来,豌豆作为遗传研究的模式植物,受到了学界和公众的广泛关注。然而,豌豆基因组非常大,组装起来相当复杂,豌豆高质量基因组精细物理图谱一直未能完成,严重阻碍了豌豆的理论和应用研究。”
相比大豆、蚕豆等,豌豆的基因组更庞大和复杂。中国农科院供图
近年来,我国生物遗传研究发展迅速,同时,我国还有丰富的作物种质储备,具有天然的研究优势。据介绍,我国作物种质库中,保存着七千多份豌豆种质资源,蕴藏着丰富的遗传多样性。早在2019年12月23日,中国农业科学院作物科学研究所王述民研究员、武晶研究员等,就在《自然-遗传学》上以长文形式发表了683份普通菜豆资源全基因组重测序结果分析,以及普通菜豆最大规模的主要农艺性状表型鉴定结果。
豌豆基因组图谱,为何难以绘制
在基因组研究中,豌豆一直缺乏高质量的基因组图谱,这给豌豆重要农艺性状的遗传解析和种质资源挖掘利用等,带来了严重的影响。
为何豌豆基因图谱这么难?宗绪晓介绍,豌豆基因组大小约为4.28Gb,是大豆的四倍,鹰嘴豆的六倍,普通菜豆的七倍,绿豆和小豆的八倍。而且,其基因组中,有超过80%的重复序列。
由于豌豆基因组的复杂性,直到2019年,国际上才公布了第一版以二代测序技术为主的豌豆参考基因组,为豆科植物基因组进化提供了新的见解。然而,由于该技术的短板,这一版基因组并不完善,且组装结果碎片化严重,尤其是在复杂的重复区域,与高质量参考基因组的标准相去甚远。
和国外豌豆种质资源相比,中国豌豆具有独特的遗传背景和丰富的遗传变异,是良好的研究资源。
在此次研究中,团队利用中国豌豆主栽品种“中豌6号”,基于多种先进测序技术,整合优化多种组装策略,提供了显著改进的豌豆高质量精细物理图谱和注释。中豌6号基因组组装大小约为3.8Gb,团队还综合了多种基因组组装评估方法,结果都显示,该基因组在复杂重复区域和转座子连续性、准确性和完整性方面都有优异表现。
中豌6号形态特征及豌豆种质资源多样性。中国农科院供图
向孟德尔致敬 豌豆育种迎来新阶段
在研究中,科研人员分析鉴定出了25个与12个豌豆重要农艺性状相关的数量性状位点,还发现了两个先前已知的控制粒型(圆粒/皱粒)和株高(高/矮)的孟德尔基因,以及一个与荚型(硬荚/软荚)相关的候选基因。
研究人员还揭示了118个栽培和野生豌豆种质的基因组变异式样,这一成果解决了长期以来关于豌豆属物种划分的争议,证明埃塞俄比亚豌豆是与野生豌豆和栽培豌豆不同的独立物种,为豌豆起源驯化提供了新的见解。科研人员构建了包含116个栽培和野生豌豆种质的泛基因组,聚类生成了112,776个泛基因簇,在豌豆属下不同物种之间,显示出差异显著的存在/缺失变异模式和功能富集,其中,野生豌豆和埃塞俄比亚豌豆中特有的泛基因显示出明显不同的功能富集,表明它们在未来作为豌豆育种资源的重要潜力。
2022年是孟德尔诞辰200周年,宗绪晓表示,豌豆高质量参考基因组和泛基因组的发布,拓宽了我们对豌豆巨大基因组背后遗传学的了解,为豌豆种质资源和育种改良研究提供了宝贵的基因组资源。
据了解,该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、食用豆现代产业技术体系、作物种质资源保护和中国农业科学院创新工程等项目的支持。作科所杨涛副研究员和刘荣助理研究员、中科院微生物所骆迎峰副研究员和胡松年研究员以及山东省农科院农作物种质资源研究所王栋助理研究员为论文的共同第一作者。作科所宗绪晓研究员、中科院微生物所高胜寒特别研究助理、山东省农科院农作物种质资源研究所丁汉凤研究员、国际半干旱热带作物研究所和澳大利亚默多克大学Rajeev K Varshney教授为论文的共同通讯作者。
新京报记者 周怀宗
编辑 唐峥 校对 赵琳
2、腊月二十三吃什么:腊月二十三小年吃什么食物 腊月二十三这些传统美食别错过
腊月二十三小年吃什么食物 腊月二十三这些传统美食别错过
北方:
1、饺子:北方腊月二十三的晚上一般要吃饺子,因为这天要送灶王爷上天汇报工作,人们煮好饺子端端正正摆在供台上,取意“送行饺子迎风面”。
2、粘糕:山东部分地区每年腊月二十三都要蒸粘糕、吃粘糕。粘糕是用黄米、红枣等做成的一种甜味糕点,意在粘住灶王爷的嘴,使其向玉帝汇报工作时只讲好事。
3、麻糖:晋西北地区小年夜要吃麻糖。山西大同的麻糖是用优质小米熬成“饧”,再加入磨好的小米面搅拌均匀,通过特殊工艺发酵和固化处理,做成各种形状的糖块,有玉骨麻糖、擦酥麻糖、夹馅麻糖、瓜蛋糖、板子糖等。不管是哪种麻糖,都是为了粘住灶王爷的嘴,以免他把人间美味奢华的事报告给上天。
4、关东糖:关东糖,又叫灶王糖,一年之中只有小年前后才能吃到。关东糖是用麦芽、小米熬制而成的风味特殊的糖制品。关东糖又香又酥,粘性大,主要是祭灶用。祭灶时,要把关东糖用火烤融化涂在灶王爷嘴上,这样他到玉帝那里就不能讲坏话了。
5、糖瓜:“二十三,糖瓜粘”,这首民谣很多人应该都听过。糖瓜跟关东糖的做法相似,只是关东糖是长条型的,拉成扁圆型就是糖瓜,吃起来香酥脆甜,粘性很大。
6、炒玉米:晋东南地区腊月二十三有吃炒玉米的习俗。人们用麦芽糖把炒玉米粘起来冰冻成一块一块的,口感脆甜香酥。
7、面花:山东半岛的人们在腊月二十三这天家家户户都忙着蒸枣花馍、团圆饼、寿桃等面食,蒸出来的这些面食又叫面花。
8、火烧:河南漯河、平顶山一带小年夜这天不吃饺子,而是家家户户自己做火烧吃。火烧又叫烧饼,与小年几乎划等号,当地人讲没有火烧的小年算不上完整的小年。
南方:
1、年糕:小年,一般北方讲究包饺子,而南方更习惯做年糕。水饺形似“元宝”,年糕音似“年高”,取吉祥如意的好兆头。每年小年,在南方都是家家户户蒸年糕吃年糕的日子,意为粘住灶王的嘴,让其上天言好事,不说人间坏事。另外,海南人用椰子作配料赶制椰糕用来食用并祈福,取“年年高”的吉庆之意。
2、米饼:广西武宣、桂平等地民间有做米饼的习俗。米饼是用糯米粉做主料,花生、芝麻、白糖作配料,放入模具打制成圆形,再经高温蒸熟,吃起来别有风味,有“团团圆圆”的寓意。
3、年粽:南宁人有过小年吃“年粽”的习俗,年粽是新年吉祥的象征,俗话说:“年粽年粽,年年高中(粽)”。年粽跟端午节的凉粽不一样,它有馅,有大有小,有长有短,有圆有扁。剥去叶子后,皮是糯米,馅是绿豆和猪肉,也有人放自己喜欢的食品做馅料。
4、杀年猪:恭城瑶族自治县莲花的兰洞、西岭的新河、观音的水滨山寨等地,都有杀猪过春节的习俗。过了小年夜,那杀年猪的热闹戏就算开台了。挑选出最好的肉,或炒或炖,精心烹饪,再满满斟上一杯酒,邀请亲朋好友共享年猪宰杀后的第一顿鲜肉——庖汤。
5、汤圆:南方人冬至、小年、新年、元宵节都要吃汤圆,而且品种齐全,花样繁多。
6、荸荠:老福州祭灶,甘蔗和荸荠是必不可少的,有“甜甜蜜蜜”的含义。荸荠,则是为了取其福州方言的谐音,寓意“好运从年头一直延续到年尾”。
7、廿四团:“廿四夜吃团子”是江南许多地方的风俗,寓意着一家团团圆圆、幸福美满。在苏州,每年腊月二十四过“小年”,做团子、送团子、吃团子是必备的一道年味。苏州人祭灶中最重要的祭品便是团子,过去叫做“廿四团”。“廿四团”用糯米粉制作,馅儿有鲜肉、豆沙、萝卜丝等多种。蒸制好的团子上都要点印子,有圆的、方的、花瓣形的,用以区别不同的馅儿。
由于各地风俗习惯不同,其日期也不尽相同:
南方:
南方大部分地区:腊月廿四
江浙沪赣地区:把“腊月廿四”祭祀灶神的那天称为“祭灶”,而把“除夕前一天”称为小年夜,与除夕当天“大年夜”相对,这里的“大年夜”和“小年夜”都是指一整天,并不一定是夜晚,也没有“小年”这种说法。
台湾地区:除夕前一天
南京地区:正月十五,即上元节(元宵节)
部分地区有腊月二十二送灶神的习俗,这天也成为该地区的小年。
北方:
北方大部分地区:腊月廿三
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